Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pax5Q02650 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms