Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snai1Q02085 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snai1Q02085 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms