Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms