Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apoa1Q00623 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms