Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atp9bP98195 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms