Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bop1P97452 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bop1P97452 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bop1P97452 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bop1P97452 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bop1P97452 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bop1P97452 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bop1P97452 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bop1P97452 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bop1P97452 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bop1P97452 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Bop1P97452 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bop1P97452 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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