Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme1P97371 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms