Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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