Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NyxP83503 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NyxP83503 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NyxP83503 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NyxP83503 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NyxP83503 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NyxP83503 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NyxP83503 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NyxP83503 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NyxP83503 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NyxP83503 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NyxP83503 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms