Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SgcgP82348 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SgcgP82348 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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