Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx3P81067 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms