Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx2P81066 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms