Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptprn2P80560 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1292.2 ms