Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeboxP70368 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeboxP70368 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms