Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NficP70255 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NficP70255 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NficP70255 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NficP70255 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NficP70255 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NficP70255 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NficP70255 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NficP70255 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms