Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Acta2P62737 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Acta2P62737 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Acta2P62737 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms