Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnnP61807 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnnP61807 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SnnP61807 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms