Protein–RNA interactions for Protein: P59999

Arpc4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc4P59999 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc4P59999 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arpc4P59999 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Arpc4P59999 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Arpc4P59999 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arpc4P59999 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms