Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nphp4P59240 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nphp4P59240 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms