Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Cldn18P56857 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn18P56857 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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