Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CartptP56388 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CartptP56388 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CartptP56388 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CartptP56388 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms