Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XpcP51612 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XpcP51612 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpcP51612 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpcP51612 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XpcP51612 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpcP51612 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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