Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TspoP50637 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TspoP50637 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TspoP50637 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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