Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FmodP50608 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FmodP50608 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms