Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms