Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rfx1P48377 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx1P48377 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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