Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mmp9P41245 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mmp9P41245 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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