Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Rab5cP35278 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab5cP35278 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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