Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
TbpP29037 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TbpP29037 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms