Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprmP28828 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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