Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RxrbP28704 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RxrbP28704 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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