Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pde6aP27664 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde6aP27664 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pde6aP27664 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pde6aP27664 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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