Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfraP26618 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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