Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkchP23298 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkchP23298 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms