Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P20040 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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P20040 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P20040 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P20040 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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