Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NefhP19246 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NefhP19246 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NefhP19246 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms