Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18530 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18530 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18530 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18530 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18530 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18530 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18530 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18530 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18530 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18530 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms