Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pou4f1P17208 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pou4f1P17208 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms