Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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