Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms