Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DmdP11531 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms