Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P10404 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P10404 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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