Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Hoxd3P09027 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Hoxd3P09027 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Hoxd3P09027 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Hoxd3P09027 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Hoxd3P09027 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hoxd3P09027 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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