Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Egr1P08046 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Egr1P08046 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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