Protein–RNA interactions for Protein: P04944

Ig kappa chain V-VI region NQ5-78.2.6, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04944 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04944 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P04944 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P04944 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P04944 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P04944 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P04944 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P04944 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04944 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P04944 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P04944 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04944 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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