Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms