Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04214 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04214 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04214 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P04214 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms