Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Ab1P01921 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms