Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Ccl20O89093 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Ccl20O89093 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl20O89093 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl20O89093 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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