Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CopeO89079 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CopeO89079 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CopeO89079 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CopeO89079 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms